語源

agitating「扇動する」point「場所」で、大衆を扇動し反体制的な行動に仕向ける組織が潜伏する場所を”agitating point“と呼び、それを略して”アジト“となった。

和製英語

“agitating point“は和製英語。
同様の意味を英語で表現する場合は”hideout“等を使う。