「精通」という言葉には2つの異なる意味があり、それぞれの語源は以下のように説明できる。

『物事について詳しく知っていること』

精「細かく詳しいこと」通「ある事柄に詳しいこと」と同じような意味の漢字を2つ重ねて強調した言葉。

『男子の初めての射精』

精「精液」通「通る」で、「精液が体外に初めて出ること」という意味から。